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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

2023年怀化迎春年货会暨美食文化节开启******

　　华声在线1月10日讯(全媒体记者 卢嘉俊 通讯员陈东)今天，2023年怀化迎春年货会暨美食文化节开启，活动为期3天，覆盖节前年货选购及节日休闲体验。

　　年货会期间，将组织特色产品集中亮相，为市民准备用于春节期间走亲访友的精美年礼，营造具有地域特色的“年货、年礼、年味”氛围;开展“怀化名菜”和“怀化名厨”两大赛事竞技活动，全市名厨齐聚一堂，呈现60道地方特色名菜供市民品鉴，并评出20道“怀化地方名菜”和20名“怀化地方名厨”;举办打糍粑、围炉煮茶、剪纸剪窗花、猜灯谜等一系列独具地方特色的民俗活动，邀请书法大师为市民免费写春联、送春联;组织直播电商企业和网红达人，开展年货节线上直播、线上带货活动。

　　怀化市商务局副局长李华介绍，参加本次年货会的企业超过100家，将重点突出怀化地方特色产品、市民急需采购的年货产品和地方特色美食三大品类。为激发广大市民消费热情，当地政府及银行将在1至3月发放900万元消费券，并在年货会举办一系列促销活动，推动消费向好回升。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）